Gracias al perfil académico con que cuenta la plantilla docente y al trabajo de investigación colegiado realizado en las Líneas de Generación y Aplicación del Conocimiento por parte de sus Cuerpos Académicos, la Universidad Tecnológica de San Juan del Río ocupa el primer lugar nacional en Cuerpos Académicos consolidados, dentro del Subsistema de Universidades Tecnológicas y Politécnicas, al tener Consolidados ante el PROMEP a su Cuerpo Académico de Sistemas de Gestión de la Calidad y al Cuerpo Académico de Mantenimiento Industrial; dos Cuerpos Académicos más se encuentran en consolidación y otros cuatro en formación.
Como líder en este proceso de Desarrollo y Consolidación de los Cuerpos Académicos reconocidos ante PROMEP, la UTSJR participó con seis trabajos de investigación desarrollados por sus profesores, durante el “Congreso Interdisciplinario de Cuerpos Académicos 2013”, organizado por la Universidad Tecnológica del Suroeste de Guanajuato, en la ciudad de Guanajuato.
El objetivo del congreso fue el de promover la integración de los Cuerpos Académicos en este espacio de discusión y análisis para la formación y consolidación de redes que permitan una labor investigativa más eficaz y un incremento sustancial en la difusión de los nuevos conocimientos.
